Życie prywatne

Od 2009 związany jest z Antonelą Roccuzzo, która podobnie jak piłkarz pochodzi z Rosario, a oboje znają się od dzieciństwa. Para pobrała się 30 czerwca 2017 w ich rodzinnym mieście. Mają trójkę dzieci – Thiago (ur. 2 listopada 2012), Mateo (ur. 11 września 2015) i Ciro (ur. 10 marca 2018). Messi ma dwóch kuzynów, którzy zawodowo grają w piłkę nożną – Maxiego Biancucchi (występuje w paragwajskiej Olimpii Asunción) oraz Emanuela Biancucchi (występuje w paragwajskim Independiente Asunción).